要有效發揮通風空調系統的積極作用，必須強調系統的濕度控制。微生物的活性會隨著濕度的增加而增加，最適宜的相對濕度為70%～100%。因此，必須保證空調系統特別是過濾器內空氣的相對濕度不超過90%;對于初效過濾器，3天以上的平均相對濕度不應超過80%。但這樣的規定往往會導致誤解：將周圍空氣的相對濕度保持在 70% 以下就可以防止微生物污染。其實，強調相對濕度不要太高，是為了防止在寒冷的表面結露。

　　為防止新風入口處的過濾器吸入雪或雨水受潮，可在新風入口處安裝防雨百葉窗，或增加新風管道的坡度，并加一個向上彎曲的新風口管彎頭; 由于低效止水造成的潤濕，更高等級的空氣過濾器可以將進入止水的最大風速限制在 3.5 m/s 以下。為防止系統中長期(12小時)高濕度或潮濕表面，特別是過濾器、盤管和加濕器處，例如在定期關機期間，首先關閉加濕器和表面冷卻器，等待系統干燥然后關掉風扇。新風口的粗效過濾器受潮在所難免，而盤管下游側的中效過濾器(在機器的露點處，相對濕度通常為95%)也會經常受潮，由于無法控制濕度，過濾器上會滋生微生物，產生令人不快的微生物揮發性有機化合物，成為過濾器感官污染負荷的一部分。由此可見，消除微生物在過濾器上的繁殖是一個值得注意的問題。目前國內外普遍采用以下三種措施，①防止過濾器受潮;②開發疏水性過濾材料;③使用抗菌過濾材料。由于國內外尚無抗菌過濾標準，曾一度在中國市場被用作假貨。為此原因，

　　暖通空調最根本的目的是為人們提供一個安全、舒適、健康、高效的室內環境。“以保證室內空氣質量為目標的通風空調”與傳統的“以整個房間為控制對象，以溫濕度控制為中心的通風空調”在理念、思路和方法上都有所不同，體現了“以人為本”的理念。為保證空調的各項指標合格，也需要對其進行相應的空調檢測。